La saison 1999 du Championnat du Sénégal de football est la trente-quatrième édition de la première division au Sénégal. Les quatorze meilleures équipes du pays sont regroupées au sein d'une poule unique où elles s'affrontent deux fois, à domicile et à l'extérieur. À l'issue du championnat, les quatre derniers du classement sont relégués et remplacés par les deux meilleurs clubs de Division 2 afin de faire passer le championnat à 12 formations à partir de la saison prochaine.
C'est l'ASC Jeanne d'Arc qui remporte le championnat cette saison après avoir terminé en tête du classement final, avec sept points d'avance sur le tenant du titre, l'ASEC Ndiambour et dix sur la Compagnie sucrière sénégalaise. C'est le septième titre de champion du Sénégal de l'histoire du club.
Le championnat a porté le nom de Division 1 depuis sa création en 1960 jusqu'en 2008 et a été rebaptisé Ligue 1 en 2009. Les saisons en noir sont celles dont on ne connaît que le champion de façon certaine (voir le palmarès).
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Championnats nationaux de première division 1998-1999 à travers le monde