Рибосомний білок L5

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4UG0, 4V6X, 5AJ0, 4UJD, 4D67, 4D5Y, 4UJE, 4UJC

Ідентифікатори

Символи

RPL5, DBA6, L5, PPP1R135, MSTP030, Ribosomal protein L5, uL18

Зовнішні ІД

OMIM: 603634 MGI: 102854 HomoloGene: 110649 GeneCards: RPL5

Пов'язані генетичні захворювання

Diamond-Blackfan anemia^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• rRNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • structural constituent of ribosome • mRNA 3'-UTR binding • 5S rRNA binding • ubiquitin protein ligase binding • mRNA 5'-UTR binding • GO:0090645, GO:0061637 ubiquitin ligase inhibitor activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • рибосома • мембрана • focal adhesion • внутрішньоклітинний • ядерце • cytosolic large ribosomal subunit • екзосома • клітинне ядро • нуклеоплазма • ендоплазматичний ретикулум • GO:0009327 protein-containing complex • синапс • Рибонуклеопротеїни
Біологічний процес	• viral transcription • SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane • ribosomal large subunit biogenesis • translational initiation • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay • rRNA processing • ribosomal large subunit assembly • Біосинтез білків • GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of translation • protein stabilization • GO:0060564, GO:1904190 negative regulation of ubiquitin protein ligase activity • negative regulation of ubiquitin-dependent protein catabolic process • negative regulation of protein neddylation • regulation of signal transduction by p53 class mediator
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6125


100503670

Ensembl


ENSG00000122406


ENSMUSG00000058558

UniProt


P46777 Q5T7N0


P47962

RefSeq (мРНК)


NM_000969


NM_016980

RefSeq (білок)


NP_000960


NP_058676

Локус (UCSC)

Хр. 1: 92.83 – 92.84 Mb

Хр. 5: 108.05 – 108.06 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

Рибосомний білок L5 (англ. Ribosomal protein L5) – білок, який кодується геном RPL5, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 297 амінокислот, а молекулярна маса — 34 363^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGFVKVVKNK	AYFKRYQVKF	RRRREGKTDY	YARKRLVIQD	KNKYNTPKYR
MIVRVTNRDI	ICQIAYARIE	GDMIVCAAYA	HELPKYGVKV	GLTNYAAAYC
TGLLLARRLL	NRFGMDKIYE	GQVEVTGDEY	NVESIDGQPG	AFTCYLDAGL
ARTTTGNKVF	GALKGAVDGG	LSIPHSTKRF	PGYDSESKEF	NAEVHRKHIM
GQNVADYMRY	LMEEDEDAYK	KQFSQYIKNS	VTPDMMEEMY	KKAHAAIREN
PVYEKKPKKE	VKKKRWNRPK	MSLAQKKDRV	AQKKASFLRA	QERAAES

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Цей білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, рибосомних білків. Білок має сайт для зв'язування з РНК, рРНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Frigerio J.-M., Dagorn J.-C., Iovanna J.L. (1995). Cloning, sequencing and expression of the L5, L21, L27a, L28, S5, S9, S10 and S29 human ribosomal protein mRNAs. Biochim. Biophys. Acta. 1262: 64—68. PMID 7772601 DOI:10.1016/0167-4781(95)00045-I
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kim J.-M., Cha J.-Y., Marshak D.R., Bae Y.-S. (1996). Interaction of the beta subunit of casein kinase II with the ribosomal protein L5. Biochem. Biophys. Res. Commun. 226: 180—186. PMID 8806611 DOI:10.1006/bbrc.1996.1330
Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з Рибосомний білок L5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10360 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.
↑ UniProt, P46777 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також

Хромосома 1

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Біосинтез білків: трансляція (трансляція прокаріотів, трансляція еукаріотів)

Білки

Фактори ініціації трансляції

Фактори ініціації трансляції прокаріотів

PIF-1
PIF-2
PIF-3

Фактори ініціації трансляції археїв

aIF1
aIF2
aIF5
aIF6

Фактори ініціації трансляції еукаріотів

eIF1	eIF1 AX AY B

eIF2	α β γ eIF2B 1 2 3 4 5 кіназа eIF2A eIF2D

eIF3	A B C D E F G H I J K L M

eIF4	EIF4A2 A3 B E1 E2 E3 G1 G2 G3 H

eIF5	EIF5 A A2 5B

eIF6	EIF6

Фактори елонгації трансляції

Фактори елонгації трансляції прокаріотів	EF-Tu EF-Ts EF-G

Фактори елонгації трансляції археїв	aEF-1, aEF-2

Фактори елонгації трансляції еукаріотів	EEF-1 A1 A2 A3 B1 B2 B3 B4 D E1 G EEF2

Фактори термінації трансляції

Фактори термінації трансляції прокаріотів
Фактори термінації трансляції археїв
Фактори термінації трансляції еукаріотів

Клас 1
- eRF1
Клас 2/RF3
- GSPT1
- GSPT2

Рибосомні білки

Цитоплазмові

підрозділ 60S	RPL3 4 5 6 7 7A 8 9 10 A L 11 12 13 13A 14 15 17 18 18A 19 21 22 23 23A 24 26 27 27A 28 29 30 31 32 34 35 35A 36 36A 37 37A 38 39 40 41 P0 P1 P2 RRP15 RSL24D1

підрозділ 40S	RPSA 2 3 3A RPS4 X Y1 Y2 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 15A 16 17 18 19 20 21 23 24 25 26 27 27A 28 29 30 RACK1

Мітохондріальні

підрозділ 39S	MRPL1 2 3 4 6 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58

підрозділ 28S	MRPS1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 14 15 16 17 18 A B C 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 33 34 35 36