GAD1 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/0e/Protein_GAD1_PDB_2okj.png/250px-Protein_GAD1_PDB_2okj.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2OKJ, 3VP6 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | GAD1, CPSQ1, GAD, SCP, glutamate decarboxylase 1, DEE89 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605363 MGI: 95632 HomoloGene: 635 GeneCards: GAD1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • каталітична активність • lyase activity • protein heterodimerization activity • pyridoxal phosphate binding • carboxy-lyase activity • glutamate binding • glutamate decarboxylase activity • protein N-terminus binding |
---|
Клітинна компонента | • vesicle membrane • клітинна мембрана • clathrin-sculpted gamma-aminobutyric acid transport vesicle membrane • внутрішньоклітинний • presynaptic active zone • цитоплазма • cell cortex • аксон • axon terminus • neuron projection terminus • синапс • inhibitory synapse |
---|
Біологічний процес | • gamma-aminobutyric acid biosynthetic process • glutamate catabolic process • carboxylic acid metabolic process • neurotransmitter biosynthetic process • protein-pyridoxal-5-phosphate linkage • glutamate decarboxylation to succinate • chemical synaptic transmission • соціальна поведінка • locomotory exploration behavior • GO:0010554 neurotransmitter secretion |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/cc/PBB_GE_GAD1_205278_at_fs.png/250px-PBB_GE_GAD1_205278_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/3c/PBB_GE_GAD1_206670_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_GAD1_206670_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/59/PBB_GE_GAD1_206669_at_fs.png/250px-PBB_GE_GAD1_206669_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 170.81 – 170.86 Mb | Хр. 2: 70.38 – 70.43 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
GAD1 (англ. Glutamate decarboxylase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 594 амінокислот, а молекулярна маса — 66 897[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MASSTPSSSA | | TSSNAGADPN | | TTNLRPTTYD | | TWCGVAHGCT | | RKLGLKICGF |
LQRTNSLEEK | | SRLVSAFKER | | QSSKNLLSCE | | NSDRDARFRR | | TETDFSNLFA |
RDLLPAKNGE | | EQTVQFLLEV | | VDILLNYVRK | | TFDRSTKVLD | | FHHPHQLLEG |
MEGFNLELSD | | HPESLEQILV | | DCRDTLKYGV | | RTGHPRFFNQ | | LSTGLDIIGL |
AGEWLTSTAN | | TNMFTYEIAP | | VFVLMEQITL | | KKMREIVGWS | | SKDGDGIFSP |
GGAISNMYSI | | MAARYKYFPE | | VKTKGMAAVP | | KLVLFTSEQS | | HYSIKKAGAA |
LGFGTDNVIL | | IKCNERGKII | | PADFEAKILE | | AKQKGYVPFY | | VNATAGTTVY |
GAFDPIQEIA | | DICEKYNLWL | | HVDAAWGGGL | | LMSRKHRHKL | | NGIERANSVT |
WNPHKMMGVL | | LQCSAILVKE | | KGILQGCNQM | | CAGYLFQPDK | | QYDVSYDTGD |
KAIQCGRHVD | | IFKFWLMWKA | | KGTVGFENQI | | NKCLELAEYL | | YAKIKNREEF |
EMVFNGEPEH | | TNVCFWYIPQ | | SLRGVPDSPQ | | RREKLHKVAP | | KIKALMMESG |
TTMVGYQPQG | | DKANFFRMVI | | SNPAATQSDI | | DFLIEEIERL | | GQDL |
Кодований геном білок за функціями належить до ліаз, декарбоксилаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з піридоксаль-фосфатом.
Література
- Bu D.-F., Tobin A.J. (1994). The exon-intron organization of the genes (GAD1 and GAD2) encoding two human glutamate decarboxylases (GAD67 and GAD65) suggests that they derive from a common ancestral GAD. Genomics. 21: 222—228. PMID 8088791 DOI:10.1006/geno.1994.1246
- Kelly C.D., Carter N.D., Johnstone A.P., Nussey S.S. (1991). Cloning of large isoform of human brain glutamic acid decarboxylase. Lancet. 338: 1468—1469. PMID 1683462 DOI:10.1016/0140-6736(91)92780-6
- Yamashita K., Cram D.S., Harrison L.C. (1993). Molecular cloning of full-length glutamic acid decarboxylase 67 from human pancreas and islets. Biochem. Biophys. Res. Commun. 192: 1347—1352. PMID 8507202 DOI:10.1006/bbrc.1993.1564
- Chessler S.D., Lernmark A. (2000). Alternative splicing of GAD67 results in the synthesis of a third form of glutamic-acid decarboxylase in human islets and other non-neural tissues. J. Biol. Chem. 275: 5188—5192. PMID 10671565 DOI:10.1074/jbc.275.7.5188
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Cram D.S., Barnett L.D., Joseph J.L., Harrison L.C. (1991). Cloning and partial nucleotide sequence of human glutamic acid decarboxylase cDNA from brain and pancreatic islets. Biochem. Biophys. Res. Commun. 176: 1239—1244. PMID 2039509 DOI:10.1016/0006-291X(91)90418-7
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4092 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q99259 (англ.) . Архів оригіналу за 26 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |