RNASEH2A

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3P56, 3PUF

Ідентифікатори

Символи

RNASEH2A, AGS4, JUNB, RNASEHI, RNHIA, RNHL, ribonuclease H2 subunit A, THSD8

Зовнішні ІД

OMIM: 606034 MGI: 1916974 HomoloGene: 4664 GeneCards: RNASEH2A

Пов'язані генетичні захворювання

Aicardi-Goutieres syndrome^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• RNA binding • nucleic acid binding • nuclease activity • endonuclease activity • RNA-DNA hybrid ribonuclease activity • ribonuclease activity • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу
Клітинна компонента	• ribonuclease H2 complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес	• DNA mismatch repair • реплікація ДНК • Деградація РНК • RNA metabolic process • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic • RNA phosphodiester bond hydrolysis • DNA replication, removal of RNA primer
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10535


69724

Ensembl


ENSG00000104889


ENSMUSG00000052926

UniProt


O75792


Q9CWY8

RefSeq (мРНК)


NM_006397


NM_027187 NM_001364370

RefSeq (білок)


NP_006388


NP_081463 NP_001351299

Локус (UCSC)

Хр. 19: 12.81 – 12.81 Mb

Хр. 8: 85.68 – 85.7 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RNASEH2A (англ. Ribonuclease H2 subunit A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 299 амінокислот, а молекулярна маса — 33 395^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDLSELERDN	TGRCRLSSPV	PAVCRKEPCV	LGVDEAGRGP	VLGPMVYAIC
YCPLPRLADL	EALKVADSKT	LLESERERLF	AKMEDTDFVG	WALDVLSPNL
ISTSMLGRVK	YNLNSLSHDT	ATGLIQYALD	QGVNVTQVFV	DTVGMPETYQ
ARLQQSFPGI	EVTVKAKADA	LYPVVSAASI	CAKVARDQAV	KKWQFVEKLQ
DLDTDYGSGY	PNDPKTKAWL	KEHVEPVFGF	PQFVRFSWRT	AQTILEKEAE
DVIWEDSASE	NQEGLRKITS	YFLNEGSQAR	PRSSHRYFLE	RGLESATSL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, нуклеаз, ендонуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів. Локалізований у ядрі.

Література

Frank P., Braunshofer-Reiter C., Wintersberger U., Grimm R., Buesen W. (1998). Cloning of the cDNA encoding the large subunit of human RNase HI, a homologue of the prokaryotic RNase HII. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 12872—12877. PMID 9789007 DOI:10.1073/pnas.95.22.12872
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з RNASEH2A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18518 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, O75792 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.