SERPIND1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1JMO, 1JMJ, 2NAT | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SERPIND1, D22S673, HC2, HCF2, HCII, HLS2, LS2, THPH10, serpin family D member 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 142360 MGI: 96051 HomoloGene: 36018 GeneCards: SERPIND1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
heparin cofactor 2 deficiency[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • peptidase inhibitor activity • endopeptidase inhibitor activity • heparin binding • serine-type endopeptidase inhibitor activity |
---|
Клітинна компонента | • екзосома • міжклітинний простір • endoplasmic reticulum lumen • extracellular region |
---|
Біологічний процес | • negative regulation of peptidase activity • біолюмінесценція • гемостаз • хемотаксис • зсідання крові • negative regulation of endopeptidase activity • посттрансляційна модифікація |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 22: 20.77 – 20.79 Mb | Хр. 16: 17.15 – 17.16 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SERPIND1 (англ. Serpin family D member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 499 амінокислот, а молекулярна маса — 57 071[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MKHSLNALLI | | FLIITSAWGG | | SKGPLDQLEK | | GGETAQSADP | | QWEQLNNKNL |
SMPLLPADFH | | KENTVTNDWI | | PEGEEDDDYL | | DLEKIFSEDD | | DYIDIVDSLS |
VSPTDSDVSA | | GNILQLFHGK | | SRIQRLNILN | | AKFAFNLYRV | | LKDQVNTFDN |
IFIAPVGIST | | AMGMISLGLK | | GETHEQVHSI | | LHFKDFVNAS | | SKYEITTIHN |
LFRKLTHRLF | | RRNFGYTLRS | | VNDLYIQKQF | | PILLDFKTKV | | REYYFAEAQI |
ADFSDPAFIS | | KTNNHIMKLT | | KGLIKDALEN | | IDPATQMMIL | | NCIYFKGSWV |
NKFPVEMTHN | | HNFRLNEREV | | VKVSMMQTKG | | NFLAANDQEL | | DCDILQLEYV |
GGISMLIVVP | | HKMSGMKTLE | | AQLTPRVVER | | WQKSMTNRTR | | EVLLPKFKLE |
KNYNLVESLK | | LMGIRMLFDK | | NGNMAGISDQ | | RIAIDLFKHQ | | GTITVNEEGT |
QATTVTTVGF | | MPLSTQVRFT | | VDRPFLFLIY | | EHRTSCLLFM | | GRVANPSRS |
Кодований геном білок за функціями належить до інгібіторів протеаз, інгібіторів серинових протеаз, світлочутливих білків. Задіяний у таких біологічних процесах як зсідання крові, гемостаз, хемотаксис, люмінесценція. Білок має сайт для зв'язування з молекулою гепарину.
Література
- Blinder M.A., Marasa J.C., Reynolds C.H., Deaven L.L., Tollefsen D.M. (1988). Heparin cofactor II: cDNA sequence, chromosome localization, restriction fragment length polymorphism, and expression in Escherichia coli. Biochemistry. 27: 752—759. PMID 2894851 DOI:10.1021/bi00402a039
- Ragg H. (1986). A new member of the plasma protease inhibitor gene family. Nucleic Acids Res. 14: 1073—1088. PMID 3003690 DOI:10.1093/nar/14.2.1073
- Inhorn R.C., Tollefsen D.M. (1986). Isolation and characterization of a partial cDNA clone for heparin cofactor II1. Biochem. Biophys. Res. Commun. 137: 431—436. PMID 3755044 DOI:10.1016/0006-291X(86)91228-3
- Griffith M.J., Noyes C.M., Tyndall J.A., Church F.C. (1985). Structural evidence for leucine at the reactive site of heparin cofactor II. Biochemistry. 24: 6777—6782. PMID 3907702 DOI:10.1021/bi00345a008
- Baglin T.P., Carrell R.W., Church F.C., Esmon C.T., Huntington J.A. (2002). Crystal structures of native and thrombin-complexed heparin cofactor II reveal a multistep allosteric mechanism. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 11079—11084. PMID 12169660 DOI:10.1073/pnas.162232399
- Ragg H., Preibisch G. (1988). Structure and expression of the gene coding for the human serpin hLS2. J. Biol. Chem. 263: 12129—12134. PMID 2841345
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з SERPIND1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4838 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.
- ↑ UniProt, P05546 (англ.) . Архів оригіналу за 28 грудня 2016. Процитовано 6 лютого 2017.
Див. також
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |