XCL1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1J8I, 1J9O, 2HDM, 2JP1, 2NYZ, 2N54

Ідентифікатори

Символи

XCL1, ATAC, LPTN, LTN, SCM-1, SCM-1a, SCM1, SCM1A, SCYC1, X-C motif chemokine ligand 1

Зовнішні ІД

OMIM: 600250 MGI: 104593 HomoloGene: 2250 GeneCards: XCL1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• chemokine receptor binding • cytokine activity • protein homodimerization activity • chemokine activity • CCR chemokine receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• extracellular region • міжклітинний простір
Біологічний процес	• cellular response to transforming growth factor beta stimulus • cellular response to interleukin-4 • release of sequestered calcium ion into cytosol • negative regulation of interferon-gamma production • positive regulation of T-helper 1 cell cytokine production • monocyte chemotaxis • positive regulation of interleukin-10 production • positive regulation of natural killer cell chemotaxis • chemokine-mediated signaling pathway • positive regulation of CD4-positive, alpha-beta T cell proliferation • cellular response to tumor necrosis factor • cell-cell signaling • positive regulation of thymocyte migration • response to virus • positive regulation of T cell mediated cytotoxicity • positive regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol • negative regulation of T-helper 1 type immune response • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity • neutrophil chemotaxis • хемотаксис • positive regulation of leukocyte chemotaxis • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • positive regulation of granzyme A production • positive regulation of immunoglobulin production in mucosal tissue • negative regulation of T cell cytokine production • positive regulation of T cell cytokine production • cellular response to interleukin-1 • positive regulation of T cell chemotaxis • mature natural killer cell chemotaxis • regulation of inflammatory response • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • positive regulation of neutrophil chemotaxis • cellular response to interferon-gamma • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • positive regulation of B cell chemotaxis • positive regulation of transforming growth factor beta production • negative regulation of CD4-positive, alpha-beta T cell proliferation • positive regulation of T-helper 2 cell cytokine production • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of CD8-positive, alpha-beta T cell proliferation • negative regulation of interleukin-2 production • negative regulation of T-helper 1 cell activation • positive regulation of granzyme B production • GO:0072468 сигнальна трансдукція • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide • regulation of signaling receptor activity • G protein-coupled receptor signaling pathway • inflammatory response • lymphocyte chemotaxis
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6375


16963

Ensembl


ENSG00000143184


ENSMUSG00000026573

UniProt


P47992


P47993

RefSeq (мРНК)


NM_002995


NM_008510

RefSeq (білок)


NP_002986


NP_032536

Локус (UCSC)

Хр. 1: 168.58 – 168.58 Mb

Хр. 1: 164.76 – 164.76 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

XCL1 (англ. X-C motif chemokine ligand 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 114 амінокислот, а молекулярна маса — 12 517^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRLLILALLG	ICSLTAYIVE	GVGSEVSDKR	TCVSLTTQRL	PVSRIKTYTI
TEGSLRAVIF	ITKRGLKVCA	DPQATWVRDV	VRSMDRKSNT	RNNMIQTKPT
GTQQSTNTAV	TLTG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до цитокінів. Задіяний у такому біологічному процесі як хемотаксис. Секретований назовні.

Література

Yoshida T., Imai T., Kakizaki M., Nishimura M., Yoshie O. (1995). Molecular cloning of a novel C or gamma type chemokine, SCM-1. FEBS Lett. 360: 155—159. PMID 7875320 DOI:10.1016/0014-5793(95)00093-O
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10645 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
↑ UniProt, P47992 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.