NKX6-1

NKX6-1
Ідентифікатори
Символи NKX6-1, NKX6.1, NKX6A, NK6 homeobox 1
Зовнішні ІД OMIM: 602563 MGI: 1206039 HomoloGene: 4495 GeneCards: NKX6-1
Онтологія гена
Молекулярна функція

GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
sequence-specific DNA binding
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
chromatin binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
DNA binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

клітинне ядро
екзосома

Біологічний процес

smoothened signaling pathway
detection of glucose
pancreas development
transcription, DNA-templated
regulation of axon extension
multicellular organism development
cellular response to peptide hormone stimulus
central nervous system neuron differentiation
response to nicotine
negative regulation of glial cell differentiation
type B pancreatic cell proliferation
cellular response to cytokine stimulus
positive regulation of DNA-binding transcription factor activity
Нейрогенез
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
type B pancreatic cell development
positive regulation of neuron differentiation
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
positive regulation of type B pancreatic cell development
type B pancreatic cell maturation
oligodendrocyte differentiation
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
проліферація
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
transcription by RNA polymerase II
positive regulation of glial cell differentiation
диференціація клітин
positive regulation of insulin secretion
animal organ morphogenesis
regulation of neuron migration
neuron migration
regulation of insulin secretion
endocrine pancreas development
type B pancreatic cell differentiation

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
4825
18096
Ensembl
ENSG00000163623
ENSMUSG00000035187
UniProt
P78426
Q99MA9
RefSeq (мРНК)
NM_006168
NM_144955
RefSeq (білок)
NP_006159
NP_659204
Локус (UCSC) Хр. 4: 84.49 – 84.5 Mb Хр. 5: 101.81 – 101.81 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

NKX6-1 (англ. NK6 homeobox 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 367 амінокислот, а молекулярна маса — 37 849[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MLAVGAMEGTRQSAFLLSSPPLAALHSMAEMKTPLYPAAYPPLPAGPPSS
SSSSSSSSSPSPPLGTHNPGGLKPPATGGLSSLGSPPQQLSAATPHGIND
ILSRPSMPVASGAALPSASPSGSSSSSSSSASASSASAAAAAAAAAAAAA
SSPAGLLAGLPRFSSLSPPPPPPGLYFSPSAAAVAAVGRYPKPLAELPGR
TPIFWPGVMQSPPWRDARLACTPHQGSILLDKDGKRKHTRPTFSGQQIFA
LEKTFEQTKYLAGPERARLAYSLGMTESQVKVWFQNRRTKWRKKHAAEMA
TAKKKQDSETERLKGASENEEEDDDYNKPLDPNSDDEKITQLLKKHKSSS
GGGGGLLLHASEPESSS

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7839 (англ.) . Архів оригіналу за 22 грудня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.
  4. UniProt, P78426 (англ.) . Архів оригіналу за 21 грудня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 4
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші